Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CilpQ66K08 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CilpQ66K08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms