Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fgfr1opQ66JX5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fgfr1opQ66JX5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fgfr1opQ66JX5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms