Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Stx3Q64704 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stx3Q64704 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stx3Q64704 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms