Protein–RNA interactions for Protein: Q64522

Hist2h2ab, Histone H2A type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2abQ64522 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hist2h2abQ64522 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hist2h2abQ64522 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms