Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nhlh2Q64221 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh2Q64221 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms