Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ccdc18Q640L5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc18Q640L5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc18Q640L5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc18Q640L5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
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