Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps72Q62481 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps72Q62481 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps72Q62481 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms