Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CcncQ62447 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcncQ62447 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CcncQ62447 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CcncQ62447 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CcncQ62447 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcncQ62447 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcncQ62447 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcncQ62447 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CcncQ62447 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CcncQ62447 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms