Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp1Q62442 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp1Q62442 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms