Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Epha6Q62413 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Epha6Q62413 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Epha6Q62413 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms