Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ss18Q62280 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ss18Q62280 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ss18Q62280 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ss18Q62280 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ss18Q62280 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ss18Q62280 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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