Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim21Q62191 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim21Q62191 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim21Q62191 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim21Q62191 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim21Q62191 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim21Q62191 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim21Q62191 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim21Q62191 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim21Q62191 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim21Q62191 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim21Q62191 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim21Q62191 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim21Q62191 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim21Q62191 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim21Q62191 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim21Q62191 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim21Q62191 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim21Q62191 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms