Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema4bQ62179 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema4bQ62179 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms