Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a2Q62148 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aldh1a2Q62148 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aldh1a2Q62148 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms