Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sin3bQ62141 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sin3bQ62141 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms