Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Odf1Q61999 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms