Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrn1Q61809 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrn1Q61809 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms