Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lama3Q61789 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lama3Q61789 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lama3Q61789 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms