Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Ifi47Q61635 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Ifi47Q61635 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ifi47Q61635 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ifi47Q61635 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Ifi47Q61635 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifi47Q61635 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifi47Q61635 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifi47Q61635 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifi47Q61635 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifi47Q61635 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifi47Q61635 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifi47Q61635 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifi47Q61635 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifi47Q61635 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifi47Q61635 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms