Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik5Q61626 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik5Q61626 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grik5Q61626 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik5Q61626 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik5Q61626 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms