Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Erbb3Q61526 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Erbb3Q61526 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erbb3Q61526 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms