Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dsg1aQ61495 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dsg1aQ61495 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dsg1aQ61495 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms