Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AlcamQ61490 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AlcamQ61490 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AlcamQ61490 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms