Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Irf9Q61179 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf9Q61179 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irf9Q61179 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms