Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9a1Q61165 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a1Q61165 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a1Q61165 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms