Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf4bQ61136 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf4bQ61136 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms