Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Foxd3Q61060 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxd3Q61060 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms