Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rbbp7Q60973 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rbbp7Q60973 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms