Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Meis1Q60954 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Meis1Q60954 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms