Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HellsQ60848 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HellsQ60848 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HellsQ60848 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HellsQ60848 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HellsQ60848 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HellsQ60848 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HellsQ60848 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HellsQ60848 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HellsQ60848 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HellsQ60848 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.9 ms