Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stxbp3Q60770 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stxbp3Q60770 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stxbp3Q60770 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms