Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csnk2a1Q60737 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csnk2a1Q60737 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Csnk2a1Q60737 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms