Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PmelQ60696 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PmelQ60696 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PmelQ60696 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PmelQ60696 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PmelQ60696 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PmelQ60696 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PmelQ60696 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PmelQ60696 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmelQ60696 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmelQ60696 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmelQ60696 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PmelQ60696 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmelQ60696 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms