Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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PtprnQ60673 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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PtprnQ60673 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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PtprnQ60673 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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PtprnQ60673 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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PtprnQ60673 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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PtprnQ60673 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprnQ60673 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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PtprnQ60673 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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PtprnQ60673 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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PtprnQ60673 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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PtprnQ60673 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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PtprnQ60673 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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PtprnQ60673 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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