Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CttnQ60598 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CttnQ60598 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CttnQ60598 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CttnQ60598 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CttnQ60598 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CttnQ60598 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CttnQ60598 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CttnQ60598 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CttnQ60598 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CttnQ60598 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CttnQ60598 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CttnQ60598 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CttnQ60598 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CttnQ60598 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CttnQ60598 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CttnQ60598 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CttnQ60598 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CttnQ60598 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CttnQ60598 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CttnQ60598 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CttnQ60598 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CttnQ60598 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CttnQ60598 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CttnQ60598 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CttnQ60598 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CttnQ60598 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CttnQ60598 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CttnQ60598 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
CttnQ60598 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CttnQ60598 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CttnQ60598 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CttnQ60598 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CttnQ60598 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CttnQ60598 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CttnQ60598 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CttnQ60598 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CttnQ60598 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CttnQ60598 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CttnQ60598 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms