Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Sin3aQ60520 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Sin3aQ60520 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms