Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema5bQ60519 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema5bQ60519 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms