Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tdrd5Q5VCS6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tdrd5Q5VCS6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms