Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdcp1Q5U462 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdcp1Q5U462 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdcp1Q5U462 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms