Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Med13Q5SWW4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med13Q5SWW4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms