Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mks1Q5SW45 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mks1Q5SW45 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139 ms