Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sft2d1Q5SSN7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms