Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85aQ5SP85 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc85aQ5SP85 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc85aQ5SP85 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms