Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PkdccQ5RJI4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PkdccQ5RJI4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PkdccQ5RJI4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms