Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlha9Q5RJB0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlha9Q5RJB0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms