Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm11487Q5RIS0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm11487Q5RIS0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm11487Q5RIS0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm11487Q5RIS0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm11487Q5RIS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Gm11487Q5RIS0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Gm11487Q5RIS0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Gm11487Q5RIS0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Gm11487Q5RIS0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Gm11487Q5RIS0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Gm11487Q5RIS0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm11487Q5RIS0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Gm11487Q5RIS0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms