Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv4Q5R1A3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trdv4Q5R1A3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms