Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtp3Q5QGU6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms