Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nsrp1Q5NCR9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nsrp1Q5NCR9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsrp1Q5NCR9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms