Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC57

Fam183b, Protein FAM183B, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam183bQ5NC57 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam183bQ5NC57 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam183bQ5NC57 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms